MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 53188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021082	TC	3	6	21	26	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021082	T	6	6	50	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021082	TAA	2	6	75	80	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021082	AAT	2	6	82	87	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021082	TTG	2	6	234	239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884695
6	NC_021082	T	6	6	289	294	0 %	100 %	0 %	0 %	482884695
7	NC_021082	TGG	2	6	312	317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884695
8	NC_021082	A	6	6	373	378	100 %	0 %	0 %	0 %	482884695
9	NC_021082	CAA	2	6	488	493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884695
10	NC_021082	GTG	2	6	494	499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884695
11	NC_021082	TTA	2	6	569	574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884695
12	NC_021082	TA	3	6	624	629	50 %	50 %	0 %	0 %	482884695
13	NC_021082	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884695
14	NC_021082	A	6	6	693	698	100 %	0 %	0 %	0 %	482884695
15	NC_021082	A	6	6	701	706	100 %	0 %	0 %	0 %	482884695
16	NC_021082	CGCT	2	8	713	720	0 %	25 %	25 %	50 %	482884695
17	NC_021082	AAG	2	6	774	779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884695
18	NC_021082	ATT	2	6	824	829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884695
19	NC_021082	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	482884695
20	NC_021082	GCG	2	6	894	899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884695
21	NC_021082	TTC	2	6	948	953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884695
22	NC_021082	AAG	2	6	987	992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884695
23	NC_021082	GCC	2	6	995	1000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884695
24	NC_021082	GGAG	2	8	1042	1049	25 %	0 %	75 %	0 %	482884695
25	NC_021082	AAG	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884695
26	NC_021082	ATGGCA	2	12	1259	1270	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482884695
27	NC_021082	AACC	2	8	1285	1292	50 %	0 %	0 %	50 %	482884695
28	NC_021082	TAC	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884695
29	NC_021082	AAG	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884695
30	NC_021082	ATC	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884695
31	NC_021082	ATTACC	2	12	1463	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884696
32	NC_021082	ACA	2	6	1498	1503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884696
33	NC_021082	GT	3	6	1505	1510	0 %	50 %	50 %	0 %	482884696
34	NC_021082	TTA	2	6	1542	1547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884696
35	NC_021082	TTA	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884696
36	NC_021082	ACC	2	6	1616	1621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884696
37	NC_021082	A	6	6	1676	1681	100 %	0 %	0 %	0 %	482884696
38	NC_021082	TGA	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884696
39	NC_021082	GAA	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884696
40	NC_021082	GTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884696
41	NC_021082	TTTAG	2	10	1775	1784	20 %	60 %	20 %	0 %	482884696
42	NC_021082	TGAT	2	8	1872	1879	25 %	50 %	25 %	0 %	482884696
43	NC_021082	TTA	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884696
44	NC_021082	TGAT	2	8	2166	2173	25 %	50 %	25 %	0 %	482884696
45	NC_021082	CCG	2	6	2191	2196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884696
46	NC_021082	GAAACC	2	12	2234	2245	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482884696
47	NC_021082	TTCT	2	8	2274	2281	0 %	75 %	0 %	25 %	482884696
48	NC_021082	AAT	2	6	2318	2323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884696
49	NC_021082	AAG	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884696
50	NC_021082	ACA	2	6	2517	2522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884696
51	NC_021082	CAA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021082	A	6	6	2583	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021082	TGAT	2	8	2592	2599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021082	CGC	2	6	2704	2709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884697
55	NC_021082	TGC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884697
56	NC_021082	AAACGA	2	12	2843	2854	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	482884697
57	NC_021082	ACTG	2	8	2891	2898	25 %	25 %	25 %	25 %	482884697
58	NC_021082	TAT	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884697
59	NC_021082	CAA	2	6	3009	3014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884697
60	NC_021082	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	482884697
61	NC_021082	CCA	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884697
62	NC_021082	TGC	2	6	3206	3211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884697
63	NC_021082	TTTA	2	8	3220	3227	25 %	75 %	0 %	0 %	482884697
64	NC_021082	AAC	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884698
65	NC_021082	CCG	2	6	3428	3433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884698
66	NC_021082	GT	3	6	3439	3444	0 %	50 %	50 %	0 %	482884698
67	NC_021082	TCTGC	2	10	3477	3486	0 %	40 %	20 %	40 %	482884698
68	NC_021082	AATC	2	8	3555	3562	50 %	25 %	0 %	25 %	482884698
69	NC_021082	GTT	2	6	3645	3650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884698
70	NC_021082	TCA	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884698
71	NC_021082	AAT	2	6	3843	3848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884698
72	NC_021082	TCT	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884698
73	NC_021082	AAT	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884698
74	NC_021082	TGG	2	6	4148	4153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884698
75	NC_021082	ATT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884698
76	NC_021082	GCAC	2	8	4256	4263	25 %	0 %	25 %	50 %	482884698
77	NC_021082	TGT	3	9	4561	4569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884699
78	NC_021082	TAAA	2	8	4650	4657	75 %	25 %	0 %	0 %	482884699
79	NC_021082	TGC	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884699
80	NC_021082	CA	3	6	4725	4730	50 %	0 %	0 %	50 %	482884699
81	NC_021082	TCT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884699
82	NC_021082	GTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884699
83	NC_021082	GCAA	2	8	4833	4840	50 %	0 %	25 %	25 %	482884699
84	NC_021082	AC	3	6	4928	4933	50 %	0 %	0 %	50 %	482884699
85	NC_021082	CCG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884699
86	NC_021082	AAG	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884699
87	NC_021082	TAA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884699
88	NC_021082	TCGGA	2	10	5244	5253	20 %	20 %	40 %	20 %	482884699
89	NC_021082	ACC	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884699
90	NC_021082	GCAA	2	8	5327	5334	50 %	0 %	25 %	25 %	482884699
91	NC_021082	CCA	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884699
92	NC_021082	CACT	2	8	5402	5409	25 %	25 %	0 %	50 %	482884699
93	NC_021082	TGT	2	6	5410	5415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884699
94	NC_021082	CAG	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482884699
95	NC_021082	AC	3	6	5459	5464	50 %	0 %	0 %	50 %	482884699
96	NC_021082	CGC	2	6	5570	5575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482884699
97	NC_021082	TTC	2	6	5602	5607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884699
98	NC_021082	TGAT	2	8	5628	5635	25 %	50 %	25 %	0 %	482884699
99	NC_021082	CTT	2	6	5796	5801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884700
100	NC_021082	CTCATT	2	12	5857	5868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482884700
101	NC_021082	TA	3	6	5892	5897	50 %	50 %	0 %	0 %	482884700
102	NC_021082	TCA	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884700
103	NC_021082	GTG	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482884700
104	NC_021082	CTT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884700
105	NC_021082	TCT	2	6	6104	6109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884700
106	NC_021082	TGA	2	6	6121	6126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884700
107	NC_021082	TGC	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884700
108	NC_021082	CTG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884700
109	NC_021082	GCT	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884700
110	NC_021082	CAT	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884700
111	NC_021082	CCA	3	9	6346	6354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884700
112	NC_021082	GCAA	2	8	6377	6384	50 %	0 %	25 %	25 %	482884700
113	NC_021082	TGA	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884700
114	NC_021082	GAA	2	6	6443	6448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884700
115	NC_021082	CTT	2	6	6459	6464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884700
116	NC_021082	T	7	7	6616	6622	0 %	100 %	0 %	0 %	482884700
117	NC_021082	T	6	6	6630	6635	0 %	100 %	0 %	0 %	482884700
118	NC_021082	AG	3	6	6652	6657	50 %	0 %	50 %	0 %	482884700
119	NC_021082	TTG	2	6	6685	6690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884700
120	NC_021082	AAAG	2	8	6695	6702	75 %	0 %	25 %	0 %	482884700
121	NC_021082	AAAG	2	8	6754	6761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021082	TAG	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021082	ATT	2	6	6783	6788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021082	A	6	6	6833	6838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021082	T	7	7	6875	6881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021082	TTGGCT	2	12	6925	6936	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	482884701
127	NC_021082	GA	3	6	7012	7017	50 %	0 %	50 %	0 %	482884701
128	NC_021082	CAT	2	6	7028	7033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884701
129	NC_021082	ATG	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884701
130	NC_021082	T	6	6	7092	7097	0 %	100 %	0 %	0 %	482884701
131	NC_021082	ACC	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884701
132	NC_021082	CAA	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482884701
133	NC_021082	ATG	2	6	7131	7136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884701
134	NC_021082	AAT	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884701
135	NC_021082	TCGCAT	2	12	7187	7198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482884701
136	NC_021082	TAT	2	6	7334	7339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884701
137	NC_021082	TAA	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884701
138	NC_021082	TCT	2	6	7439	7444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884701
139	NC_021082	TGA	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884701
140	NC_021082	GA	3	6	7538	7543	50 %	0 %	50 %	0 %	482884701
141	NC_021082	CAT	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884701
142	NC_021082	AG	3	6	7569	7574	50 %	0 %	50 %	0 %	482884701
143	NC_021082	CTT	2	6	7628	7633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884701
144	NC_021082	TAA	2	6	7653	7658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884701
145	NC_021082	TTA	2	6	7726	7731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884701
146	NC_021082	ATA	2	6	7770	7775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884701
147	NC_021082	TTC	2	6	7854	7859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884701
148	NC_021082	TTCT	2	8	7895	7902	0 %	75 %	0 %	25 %	482884701
149	NC_021082	CAC	2	6	7927	7932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884701
150	NC_021082	T	6	6	7983	7988	0 %	100 %	0 %	0 %	482884701
151	NC_021082	CAT	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884701
152	NC_021082	GAT	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884701
153	NC_021082	TGC	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884701
154	NC_021082	GTT	2	6	8117	8122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884701
155	NC_021082	TACC	2	8	8144	8151	25 %	25 %	0 %	50 %	482884701
156	NC_021082	TTG	2	6	8256	8261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884701
157	NC_021082	TAT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021082	ATTT	2	8	8393	8400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021082	AAT	2	6	8423	8428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884702
160	NC_021082	TCA	2	6	8499	8504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
161	NC_021082	TCA	3	9	8523	8531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
162	NC_021082	CAAT	2	8	8686	8693	50 %	25 %	0 %	25 %	482884702
163	NC_021082	TTAA	2	8	8700	8707	50 %	50 %	0 %	0 %	482884702
164	NC_021082	CCA	2	6	8716	8721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884702
165	NC_021082	CAT	2	6	8803	8808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
166	NC_021082	CGAC	2	8	8811	8818	25 %	0 %	25 %	50 %	482884702
167	NC_021082	T	6	6	8924	8929	0 %	100 %	0 %	0 %	482884702
168	NC_021082	TTTA	2	8	9023	9030	25 %	75 %	0 %	0 %	482884702
169	NC_021082	ATC	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884702
170	NC_021082	CGG	2	6	9108	9113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482884702
171	NC_021082	TCT	2	6	9150	9155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884702
172	NC_021082	TTA	2	6	9192	9197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482884702
173	NC_021082	TTC	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884702
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178	NC_021082	TTC	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884702
179	NC_021082	CTG	2	6	9419	9424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884702
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181	NC_021082	CCACC	2	10	9454	9463	20 %	0 %	0 %	80 %	482884702
182	NC_021082	T	6	6	9482	9487	0 %	100 %	0 %	0 %	482884702
183	NC_021082	GTT	2	6	9505	9510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482884702
184	NC_021082	TAA	3	9	9608	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021082	ACA	2	6	9619	9624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_021082	A	6	6	9640	9645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021082	TGA	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482884703
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189	NC_021082	GTAA	2	8	9826	9833	50 %	25 %	25 %	0 %	482884703
190	NC_021082	AAT	2	6	9904	9909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884703
191	NC_021082	TCG	2	6	9957	9962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482884703
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238	NC_021082	ATT	2	6	12473	12478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_021082	TAA	2	6	12493	12498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_021082	TAAAT	2	10	12501	12510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_021082	CTT	2	6	13483	13488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482884709
260	NC_021082	GAA	2	6	13516	13521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884709
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263	NC_021082	CCA	2	6	13632	13637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482884709
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266	NC_021082	AAAAT	2	10	13773	13782	80 %	20 %	0 %	0 %	482884709
267	NC_021082	TAA	2	6	13856	13861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884710
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269	NC_021082	AAG	2	6	14062	14067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884710
270	NC_021082	AAG	2	6	14167	14172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884710
271	NC_021082	CTA	2	6	14189	14194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884710
272	NC_021082	TAC	2	6	14256	14261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884710
273	NC_021082	GAA	2	6	14334	14339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482884710
274	NC_021082	AATA	2	8	14358	14365	75 %	25 %	0 %	0 %	482884710
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279	NC_021082	TAA	3	9	14700	14708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482884711
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282	NC_021082	TAC	2	6	14899	14904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884711
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289	NC_021082	T	6	6	15222	15227	0 %	100 %	0 %	0 %	482884712
290	NC_021082	AGTA	2	8	15299	15306	50 %	25 %	25 %	0 %	482884712
291	NC_021082	TAC	2	6	15390	15395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482884712
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393	NC_021082	T	7	7	21341	21347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_021082	T	6	6	21383	21388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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396	NC_021082	TTAA	2	8	21407	21414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_021082	TAT	2	6	21420	21425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_021082	A	6	6	21510	21515	100 %	0 %	0 %	0 %	482884717
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